Plusieurs types de librairies sont offertes pour du séquençage NovaSeq et MiSeq, telles que :
- Librairies d’ADN (shotgun et PCR-free) pour le séquençage de génomes complets (et de métagénomes)
- Librairies d’ARN (ARNm, ARNlnc, petits ARN)
- Métabarcoding (16S/18S/ITS/Autres cibles)
- Librairies d’ADN pour l’identification de sites de méthylation
- Librairies enrichies pour des régions d’intérêt
- Captures d’exomes
- Panels personnalisés
- Sites de méthylation
- RNA-Exome
- Librairies d’amplicons
- Librairies “single cell”
- Librairies GBS (RAD, ddRAD)
- Librairies ATAC-Seq
- Librairies HiC
- Librairies ChIP-Seq
La plupart des pipelines de préparation des librairies ont été automatisés afin de réduire les coûts et augmenter la fiabilité.
Différentes longueurs de séquences (entre 100bp et 300bp) sont disponibles selon les applications. Les librairies peuvent être séquencées en format lecture simple (single-end) ou pairée (paired-end).
Les lectures sont livrées en format FASTQ et il est possible d’obtenir des fichiers BAM pour des échantillons d’origine humaine, de rat ou de souris. Les séquences sont téléchargées directement de Nanuq.
Pour connaître la quantité de données générées par chacun des instruments et déterminer les options de séquençage appropriés pour votre projet, contacter le Bureau de Gestion Client.
