PROJET EN COLLABORATION AVEC IVADO ET ONCOPOLE
De nombreux types de cancers, notamment plusieurs types de cancers du cerveau chez l’enfant, sont causés par des mutations qui modifient la façon dont les cellules peuvent accéder à leur génome, soit l’état épigénétique des cellules. L’impact de ces cancers, souvent incurables, sur les patients et leur famille est incommensurable. Il est essentiel de déterminer quelles mutations peuvent avoir ce type de conséquences extrêmes pour aider les oncologues à mettre au point de meilleurs tests diagnostiques et de meilleurs schémas thérapeutiques. Fait intéressant, ces mutations influent souvent sur la façon dont l’ADN de la cellule se replie dans son noyau, l’empêchant ainsi d’exécuter correctement son programme de développement. Dans le cadre de ce projet, nous nous appuierons sur les récentes avancées en matière d’apprentissage machine (comme les réseaux de neurones sur graphes) pour aider à cerner ces mutations et à prédire leurs conséquences épigénétiques. Nous utiliserons de plus ces approches pour mieux comprendre le moment où ces mutations se développent, ainsi que leurs causes potentielles.
Les outils ainsi développés (algorithmes, logiciel) seront rendus disponibles à la communauté biomédicale qui pourra les utiliser pour étudier les liens entre mutations génétiques et les altérations épigénétiques et leur rôle dans le développement de plusieurs types de cancer.
Centre de génomique responsable : Génome Québec
Partenaires : IVADO, Oncopole
Cochercheurs :
Nada | Jabado | Université McGill |
Josée | Dostie | Université McGill |
William | Hamilton | Université McGill |
Utilisateurs :
Michael | Taylor | Sick Kids Hospital, Toronto |
Guillaume | Bourque | Université McGill |