Ensemble des protéines exprimées dans une cellule, une partie d’une cellule (membranes, organites) ou un groupe de cellules (organe, organisme, groupe d’organismes) dans des conditions données et à un moment donné. L’étude du protéome, la protéomique, permet une meilleure compréhension du fonctionnement cellulaire à partir de l’expression protéique dans un contexte global.