Le processus par lequel des molécules (des protéines, des fragments d’ADN ou d’ARN) peuvent être séparées selon la taille et la charge électrique en leur appliquant un courant électrique. Le courant force les molécules à travers les pores d’une mince couche de gel, une substance gélatineuse ferme. Le gel peut être fabriqué de manière à ce que ses pores soient juste de la bonne dimension pour séparer les molécules à l’intérieur d’une plage de tailles et de formes spécifiques. Les plus petits fragments voyagent habituellement plus loin que les plus gros. Le processus est parfois appelé électrophorèse en gel.